Keberadaan Gua Kontilola masih sangat alami dan belum tersentuh oleh teknologi manusia. Udara dingin dan lembab akan langsung terasa saat memasuki gua. Kedalaman dari gua Kontilola pun belum diketahui secara pasti karena belum ada yang melakukan pengukuran kedalaman gua.

Sesuai namanya, Gua Kontilola menjadi tempat hidup ratusan atau bahkan mungkin ribuan kelelawar. Semakin masuk ke dalam gua, semakin banyak ditemui koloni kelelawar. Tampak di lantai gua, banyak tumpukan kotoran kelelawar. Saat sore tiba, ribuan kelelawar itu keluar dari kegelapan gua untuk mencari makanan setelah mereka tidur sepanjang siang.

Penampakan Lukisan di Dinding Gua Kontilola. (Foto FB Atlantis Indonesia)

Selain kelelawar, jejak misteri dari Gua Kontilola ini menjadi hal yang paling menarik. Misteri keberadaan lukisan di dinding gua. Lukisannya tidak seperti perwujudan manusia, namun lebih menyerupai alien. Wajah yang aneh dengan jari berjumlah empat menjadi objek lukisan di dinding gua. Masyarakat setempat percaya bahwa pada masa lalu terdapat alien yang tinggal di dalam gua dan menggambar sesuai wujud mereka.